微生物限度檢測(cè)分為染菌量的檢測(cè)和控制菌的檢測(cè)，包括以下三個(gè)檢測(cè)項(xiàng)目：
1.細(xì)菌數(shù)檢測(cè) 細(xì)菌數(shù)測(cè)定是衡量藥品質(zhì)量的重要指標(biāo)。
2.真菌數(shù)檢測(cè) 包括霉菌、酵母菌數(shù)檢測(cè)。細(xì)菌、真菌數(shù)測(cè)定是對(duì)染菌量檢測(cè)，是檢測(cè)單位質(zhì)量、體積或面積（g、ml或10cm2）的藥品中所污染活菌數(shù)量。其測(cè)定結(jié)果可用于判斷藥品被污染的程度，用于評(píng)價(jià)藥品質(zhì)量。
3.控制菌檢測(cè) 非規(guī)定滅菌制劑不但要控制微生物的數(shù)量，同時(shí)不允許含有致病菌。致病菌種類(lèi)繁多，在實(shí)際工作中不可能逐一檢測(cè)，只能結(jié)合藥品生產(chǎn)實(shí)踐中污染的可能性、潛在的危害性、檢測(cè)方法的穩(wěn)定性和可操作性，通過(guò)長(zhǎng)期的考察研究，選擇幾種致病菌或指示菌作為控制菌，通過(guò)對(duì)控制菌的檢測(cè)評(píng)價(jià)藥品的質(zhì)量，保證用藥的安全性。我國(guó)2010年版《中國(guó)藥典》規(guī)定：藥品檢測(cè)的控制菌包括大腸埃希菌、大腸菌群、沙門(mén)菌、銅綠假單胞菌、金黃色葡萄球菌、梭菌和白色念珠菌七種。對(duì)某一制劑這七種菌不必全部檢測(cè)，需檢測(cè)的種類(lèi)與藥品的劑型、給藥途徑、原料來(lái)源和醫(yī)療目的等有關(guān)。